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環境部設立用於執行減碳工作及調適氣候變遷的溫室氣體管理基金，隨著碳費開徵，預估每年將有百億元收入，成小金庫，學者認為，中央、地方攜手才能落實淨零工作，建議至少3成補助地方政府。

由於碳費還未徵收，加上空汙基金因補貼柴油車汰換，經費拮据，無餘力撥補給溫管基金。到去年為止，溫管基金負債3000餘萬，且立法院曾附帶決議，空汙基金將於2025年停止撥款。

環境部氣候變遷署組長溫育勇坦言，已獲主計總處允許，明年將撥補3.1億元公務預算及3.6億元空汙基金至溫管基金，應不會再短絀。

碳費2026年起收費，每年將有百億碳費將納入溫管基金，根據《氣候變遷因應法》，專供地方政府執行溫室氣體減量工作、補助及獎勵事業投資溫室氣體減量技術等13種用途。

氣候變遷署副署長黃偉鳴指出，環境部將依基金規模、實際需求，核定地方政府補助金額，溫管基金管理會負責監督，相關會議紀錄、資料也會公開供查閱。

台北市環保局前局長、台大環境工程學研究所兼任助理教授劉銘龍指出，地方政府財政往往僅足夠施政所需，但電動運具充電樁、屋頂型太陽光電板獎補助措施等多項國家淨零轉型基礎建設，也要經費、資源，第28屆聯合國氣候變遷大會（COP28）城市氣候行動峰會亦指出，國家減碳目標應納入地方政府參與，建議參考《溫室氣體減量及管理法》精神，至少3成碳費補助地方政府。

綠色和平專案主任徐祥誠則表示，AI產業、ICT產業陸續承諾使用100％再生能源，碳費應優先挹注再生能源發展，使其穩定供應，促進耗能重點產業深耕台灣。此外，公開溫管基金管理會會議紀錄、資料，民眾僅有知情權，盼政府將「氣候訴訟權」明定在法律當中，讓民眾擁有表達碳費運用不當的管道。