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人類基因體計畫所帶起的基因科技潮流，無疑地成為新興生物科技應用研發最大的推動力量。後基因時代中，新興的蛋白質體學、藥物基因體學、甚至於代謝體學等，都強調各種生物分子與其代表功能之間的關係，其研究成果都成為影響生技醫藥甚至於人類醫療康健甚巨的生命科學。根據美國食品暨藥物管理局 (FDA) 認為，生物標誌 (biomarker) 泛指可以利用任何生物分析方式來測量正常人體生理反應、疾病發展過程、藥物生理反應及藥物安全性等，同時可以提供作為臨床上決策依據的生物特徵，例如像是代謝的中間產物、基因表現或是蛋白質表現等等。

透過功能強大的生物資訊技術，生物標誌現在已經可以應用於醫藥研發、人體臨床試驗與藥效試驗等。這方面的應用目前已隨著 FDA 將生物標誌的應用納入了藥物臨床試驗的正式法規之後，成為未來重要的醫藥研發工具之一。雖然目前生物標誌的應用仍以醫藥研發為主，未來隨著愈來愈多經過嚴謹程序驗證過的生物標誌公諸於世之後，生物標誌也可能成為未來評估個人身體健康的指標。在此趨勢之下，包括體外檢測試驗產品、分子檢測產品、藥物基因檢測產品、研究用分析設備，甚至於檢測服務等相關市場都將因為生物標誌的出現而出現快速成長的局面。

雖然目前生物標誌的應用仍以醫藥研發為主，未來隨著愈來愈多經過嚴謹程序驗證過的生物標誌公告之後，生物標誌也可能成為未來評估個人身體健康的指標。經由生物資訊軟體協助，生物標誌資訊可以組合成的可供分析比較的分子圖譜 (pattern profile) 特徵，只需要經由軟體的比對即可以找出個體可能的潛在疾病，或是提前篩選出對那些藥物可能會產生不良副作用。

過去生物標誌大多指可以作為監測指標的一些生理特徵，在後基因體時代，包括像是基因序列或是蛋白質分子等，都是生物標誌其中之一。由於產業界對於這些生物標誌資訊愈來愈了解，應用開發出來的相關產品或服務範圍也愈來愈廣泛，甚至於美國 FDA 在近年來也公告在人體臨床試驗中應用生物標誌從事研究的管理法規。